Il “Centro Studi per la scuola cattolica” è stato costituito su delibera del Consiglio Episcopale Permanente del 23-26 settembre 1996. Con il rinnovo del Regolamento dell'Ufficio nazionale per l'educazione, la scuola e l'università, approvato dalla Presidenza CEI del 23 gennaio 2017, il Centro Studi diviene una Sezione dell'Ufficio.